DM : La régulation de l’expression des gènes
Publié le 22/06/2024
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DM : La régulation de l’expression des gènes
Dans un premier temps nous allons étudier les épinoches à trois épines qui
sont des poissons qui se présentent sous deux formes soit épinoche marine ou bien
épinoche d'eau douce, ces deux formes dépendent du lieu où elles vivent.
Mais on
sait également que leurs prédateurs varient selon les milieux de vie.
L'objectif est de
démontrer que l'expression des gènes est conditionnée par la présence de
séquences d'ADN régulatrices.
Pour débuter nous allons montrer que le gène PITX1
est responsable du développement de la nageoire pelvienne épineuse, puis par la
suite montrez que l’absence de la nageoire pelvienne épineuse chez les formes
d’eau douce et a quoi est dû cela.
Puis pour finir nous allons montrer que la
séquence réglementaire PEL de l’épinoche d’eau douce est la raison pour laquelle
les organismes d’eau douce n’ont pas de nageoires pelviennes épineuses.
Dans le document 1 on observe la morphologie des épinoches en fonction de
leur milieu de vie.
À la suite de cela on apprend que les épinoches marines
possèdent une nageoire pelvienne épineuse proéminente sur leur face ventrale, ce
qui les protège donc des gros poissons.
Cependant pour les épinoches d'eau douce
elles ne possèdent plus de nageoire pelvienne, ce qui les protège donc des larves de
libellules.
On constate donc que les épinoches marines possèdent un avantage sur
les épinoches d’eau douce ; mais cela semble normal car les prédateurs ne sont pas
les mêmes en mer et en eau douce.
Donc on voit bien que cela varie en fonction du
milieu de vie.
Par la suite dans le document 2 on observe l’expression du gène
PITX1 qui est impliqué dans la mise en place de la nageoire pelvienne épineuse au
cours du développement des épinoches.
Dans ce document on observe que le gène
PITX1 est présent seulement sur l’embryon d’épinoche marine et non sur l’épinoche
d’eau douce.
Or on sait que l’épinoche de mer possède une nageoire pelvienne
épineuse proéminente.
On apprend également que si de l’ARNm du gène PITX1 est
produit, la protéine PITX1 sera alors produite.
Donc il y a production de protéine
PITX1 grâce à la production de l’ARNm du gène PITX1.
Dans le document 4 on
observe que l’on nous donne la notion de gène de développement.
On sait qu’un
gène de développement est un gène dont l’expression intervient au cours du
développement de l’organisme et permet le développement d’un organe chez
l’individu.
Pour notre cas ici c’est la nageoire pelvienne qui est développée.
C’est
donc un gène dont la protéine va contrôler l’expression d’autres gènes permettant la
construction d’un organe fonctionnel complet.
L’absence d’expression de ce genre
de gène entraîne l’absence de l’organe dont il contrôle l’édification.
Donc c’est pour
cela que l’épinoche d’eau douce ne possède pas de nageoire pelvienne car il ne
possède pas le gène PITX1 qui est un gène de développement.
On peut donc
conclure que c’est grâce à la présence du gène PITX1 que l’on obtient la création de
la nageoire pelvienne car l’épinoche d’eau douce ne possède pas ce gène et n’a
donc pas de nageoire.
On sait donc que le gène PITX1 permet le développement de
la nageoire pelvienne épineuse et que l’on peut donc le qualifier de gène de
développement car il permet le développement d’un organe chez l’individu.
Nous allons donc chercher à savoir comment savoir que l’absence de la nageoire
pelvienne épineuse chez les formes d’eau douce est due ou pas à une mutation du
gène PITX1 ?
Dans un deuxième temps nous allons nous intéresser aux données
moléculaires du gène PITX1 pour savoir si cette absence de nageoire pelvienne est
due à une mutation.
Pour ce fait, nous avons fait une comparaison sur GenieGen 2
des séquences du gène PITX.
Comparaison du gène PITX1 d’eau douce au gène PITX1 marine.
Aucune mutation
Gene PITX1 marine
Gène PITX1 eau
Suite a cela dans le document au-dessus on observe aucune mutation présente
entre la comparaison de 2 séquences du gène PITX1.
ON peut dire qu’il n’y a
aucune présence de mutation car sur ce logiciel la présence de mutation est signalée
par une partie rouge or ici la comparaison est tout en vert donc on ne constate pas
de mutation.
On peut donc dire que l’absence de la nageoire pelvienne épineuse
chez les formes d’eau douce n’est....
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