AA Aliphatiques

« 1 / 2 AA Aliphatiques AA à chaine latérale non cyclique, polaire mais non chargée Glycine : Pas de C α asymétrique, flexible, plus petit AA, présent dans le collagène (Gly-X-Y) Alanine : peu encombrant, peut être dans le collagène, permet les tours, interchangeable avec le pyruvate dans les transaminations dans le foie  synthèse de glucose, deuxième AA le plus abondant dans sang Valine : non exposée à la surface des hélices α , agrégation des prot Leucine : non exposée à la surface des hélices α , agrégation des prot Isoleucine : non exposée à la surface des hélices α , agrégation des prot, deuxième centre de chiralité au niveau du carbone β  encombrement stérique important Proline : seul AA avec f° amine secondaire / seul à avoir une configuration cis (responsable de l’apparition d’un coude dans la chaîne peptidique) ou trans / present dans le triplet du collagène Gly,X,Y où X peut être une proline et Y une hydroxy-proline ou une hydroxy-lysine Methionine : contient un atome de soufre / précurseur de S-adenosyl-methionine, donneur de gpmt méthyle  intervient dans les régulations de méthylation de la C (ADN, prot genre histones) Fonction hydroxyle Sérine : alanine hydroxylée / O-glycosylation possible / Phosphorylable Thréonine : valine hydroxylée / O-glycosylation / Phosphorylable Fonction amide Asparagine : N-glycosylation / peut participer potentiellement à 4 l° hydrogènes Glutamine : participe au transport de l’ammoniac jusqu’au rein où il est éliminé dans les urines / AA le plus abondant dans le sang Fonction sulfhydryle Cystéine : rôle primordial dans le maintien des str III et IV : deux gmpts thiols  oxydation  l° covalente réversible entre les chaînes latérales de deux cystéines = pont disulfure / formation de la str 3D / ponts disulfures retrouvés dans str IV de l’insuline (hormone hypoglycémiante synth par pancréas / l° peut être rompue par β -mercaptoéthanol // Sous forme réduite la cystéine possède un gp sulfhydryle (-SH) Acide aminé à chaîne latérale polaire et chargée Positive : acide aminé basique (pI élevé) Lysine : gmpt amine primaire sur le carbone epsilon Arginine : charge portée par gmpt guanidium / précurseur du monoxyte d’azote et de l’ornithine Histidine : charge portée par gmpt imidazole / pkA de la chaine lat = 6  AA important dans réact enzymatiques (dans sites actifs) / Précurseur de l’histamineAA aromatiques Phenylalanine : précurseur de la tyrosine dans la réaction catalysée par la Phényl-Alanine-hydroxylase / une accumulation de Phe  saturation des transporteurs en AA (notamment dans le cerveau)  pathologie avec retard mental dans histones peut être modifiée post-trad  réguler état compacté relâché de la chromatine 2 / 2. »